Como los museos aun no poeseen sistemas de clasificación como tal a nivel mundial, el munal organizo su material de forma cronológica separando por epocas sus obras.



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1. 1550 - 1821 Asimilación de occidenteRevisa las primeras manifestaciones del arte de la pintura occidental en América y el nacimiento de la Academia de San Carlos.
2. 1810-1910 Construcción de una naciónEsboza el pensamiento de la nuevo Estado Mexicano y la forma en que sus artistas buscaron dar una identidad a la Patria por medio del arte.
3. 1910-1955 Estrategias plásticas para un México modernoExhibe obras significativas del período que vá de la Revolución Mexicana a la consolidación del movimiento Muralista.